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CRF01_AE属于HIV-1的M群，是首个被阐发的HIV-1流行重组毒株，在我国狠恶流行。自从1988年在泰国发现该毒株，20多年来对它的意识随议论花式和技艺的跳动而逐渐明晰，其流行和演变是社会和生物学成分综配合用的限定。了解这个毒株的发源和进化关于连气儿HIV-1的流行端正，进而有用防控具有要紧酷爱酷爱。
一、CRF01_AE的发现、定名和发源自从1983年分离出HIV-1，就发现其具有高度的基因多态性[1， 2]。通过对病毒基因序列的分析，发刻下进化树上欧洲/北好意思地区的序列与非洲地区的序列分开酿成不同的进化簇，据此将HIV-1分为欧洲/北好意思株和非洲株[3]。而后，跟着序列的积贮，发刻下进化树上病毒的env序列存在多个彼此间确实等距的进化支，1992年将这些进化支定名为A、B、C、D、E、F基因型，此前的欧洲/北好意思株被称为B亚型[4]。1992年，对在泰国发现的E亚型毒株进行分析，发现其env基因为E亚型，gag基因却是A亚型，推断可能为嵌合的重组体[5]。1996年进行了全长基因组序列分析，证实其确为A和E亚型的重组体(A/E)，env、vif、vpr是E亚型，gag和pol、tat、rev、vpu、5’nef和大部分LTR是A亚型[6]，病毒颗粒的膜外区为E亚型，膜里面分为A亚型[7]。泰国毒株(93TH253.3)和中非共和国的毒株(90CR402.1)具有相易的基因组嵌合结构，提醒二者有共同的发源。1998年提议HIV-1流行重组体(Circulating recombinant forms，CRF)的倡导[8]，指出它是已流行的HIV-1重组毒株，判断尺度是至少测定了2个毒株的全长基因组序列；测序的毒株具有相易的基因组结构并与已知的不同；至少在2个莫得流行病学研究的个体发现了该病毒。知足这些尺度确其时有4个重组毒株(A/E、A/G、A/G/I和A/B)，A/E是首个笃定基因组嵌合结构的，被编为第1号，定名为CRF01_AE。其时并莫得发现纯的E亚型序列，尽管刻下HIV的基因序列已极大丰富了，仍未找到纯的E亚型全长基因组序列。按照老例，这种莫得全长祖宗序列的毒株属于“Unclassfied (U)”，CRF01_AE应该是CRF01_AU。1999年9月，在新墨西哥州圣菲议论所(Santa Fe Institute)举行的HIV-1系统分类和定名会议上，通过大众投票表决，决定仍然使用CRF01_AE这个称号，办法是尽可能与已有的定名一致，幸免絮叨[9]。
1988年，在泰国发现当地流行2类HIV-1毒株，一类在其时属于北好意思/欧洲株，另一类与之前描摹的均不同，这是最早描摹的E亚型即CRF01_AE毒株[5]。1994－1995年，多项在泰国的议论均发现当地只存在E亚型和B亚型[10， 11， 12]。1989－1999年，在泰国约75万HIV感染者中，90%傍边感染的是彼此之间高度相关的E亚型毒株，显走漏奠基效应，并与中非共和国和喀麦隆的E亚型病毒高度相似。而其时在非洲地区发现的毒株却十分复杂。1993年在中非共和国发现了A、E、C和D 4种基因亚型的毒株[13]。1997年，发现通盘其时已知亚型的HIV-1毒株在刚果民主共和国皆有流行，A亚型的流行率最高(46%～69%)、C/D/G/H亚型的流行率为7%～9%、F/J/K/CRF01_AE的流行率是2%～4%[14]。
泰国与中非的毒株具有相易的基因组结构及共同的发源，泰国流行的毒株主如若CRF01_AE和B亚型，未发现A亚型。而非洲地区的HIV-1毒株具有高度的基因多态性，多种毒株共同流行。推测CRF01_AE的重组发生于E与A亚型同期流行的非洲地区。系统进化分析证实该毒株于20世纪70年代发源于中非，于80年代传入泰国[6]。
2019一本大道香蕉大在线 二、CRF01_AE的流行和进化1. CRF01_AE在大众的流行：CRF01_AE是成效流行的HIV-1重组病毒，在大众狠恶传播，北好意思、欧洲、非洲中部和西部、亚洲地区和澳大利亚皆有流行，约占大众流行HIV-1毒株的5%[15]。CRF01_AE是在东南亚地区流行的主要毒株，约占79%[15]。在东南亚列国所占的比例远离是97.2%(柬埔寨)、75.0%(印度尼西亚)、60.7%(马来西亚)、19.6%(缅甸)、12.3%(菲律宾)、66.8%(新加坡)、89.7%(泰国)和20.1%(日本)[16]。而在欧洲和北好意思地区，B亚型毒株占富余上风，CRF01_AE的流行很少。2004－2011年在好意思国采样的标本中，CRF01_AE只占0.2%，均与旅游和侨民相关[17]。在欧洲地区和以色列，性爱之后2002－2005年采样的标本中B亚型占66.12%，CRF01_AE的比例是4.0%[18]。
非洲地区是CRF01_AE大众流行和扩散的起源，以性旅游著称的泰国对这个毒株从东南亚地区到欧洲和北好意思地区的长距离扩散及大众流行发扬了中心作用在线av 中文字幕，这是由于泰国具有与亚洲其他国度、欧洲和北好意思地区密切研究的性行径相聚；欧洲和北好意思地区主如若CRF01_AE的输入地[19]。
2. CRF01_AE在中国的流行：1990年，在云南暗娼中初度发现我国的E亚型毒株[20]。随后，在福建[21]、广西[22]、深圳[23]等地的静脉吸毒(Intravenous Drug User，IDU)和经性感染东说念主群中赓续发现。而后20多年，CRF01_AE在我国流行呈飞腾态势，天下3次分子流行病学探望的限定，CRF01_AE在我国HIV感染者中所占的比例由1996－1998年的9.6%飞腾至2002－2003年的15.54%和2007－2008年的27.5%。不同路线感染东说念主群有显耀各别，2007－2008年，在IDU、异性和同性性传播感染东说念主群中所占比例远离为21.2%、39.8%、55.8%[24， 25]。CRF01_AE在我国不同地区呈不同的流行流程。在广东省，CRF01_AE在HIV感染者中所占的比例从2004年的40.7%[26]飞腾至2009年的66.9%[27]；在上海市，跟着MSM感染者比例的飞腾，CRF01_AE由2003年的不到20%[28]增至2006年的40%以上[29]以及2009－2013年的60%以上[30]；在广西壮族自治区，2006年前后HIV的传播路线由IPU转动为异性性传播为主[31]，CRF01_AE也成为富余上风的毒株，2009－2013年占比近80%[32， 33]；在北京市，MSM东说念主群中流行的HIV-1毒株2006年前后由泰西B亚型为主转动为CRF01_AE为主，2007年以来这个毒株的比例保执在约50%～60%[34， 35]；在福建省，1987－2010年CRF01_AE一直是上风毒株，比例约莫为70%～80%[36， 37]，近几年呈现下跌的趋势[38]；在云南省，CRF01_AE的流行一直保管较低的水平(约20%)[39， 40， 33]，但近几年在当地MSM中，CRF01_AE成为上风毒株，比例达到60%以上[41]。
连年来，在天下新文书的HIV感染者中，MSM所占比例快速增长，从2005年的0.7%增至2009年的10.0%和2014年的25.8%[42]。同期，MSM中HIV-1毒株的种类也发生了显耀变化，在天下13个省(市)的议论发现，CRF01_AE的比例由2009年的55.4%下跌至2014年的43.5%，CRF07_BC由25.6%飞腾至40.1%，泰西B亚型则由16.0%下跌至3.8%[42]。
CRF01_AE毒株在我国进化为几个显耀的流行簇，意味着感染这个毒株的东说念主群间存在复杂的传播关系，但对流行簇的数量和特征尚未有一致的论断。在辽宁省，CRF01_AE占2008－2010年MSM东说念主群中新近感染者的84%，分为2个流行簇[43]。2009－2011年对中国9个城市(沈阳、北京、济南、上海、南京、成皆、长沙、昆明、东莞)583名MSM东说念主群中HIV感染者的议论，发现CRF01_AE占62.1%，分为2个流行簇，预计远离在1999年和2001年传入该东说念主群，有显耀的奠基效应[44]。2002－2010年采集的天下鸿沟408条CRF01_AE的gag基因片断进行系统进化分析，发现其分为4个进化簇[45]。对75条我国CRF01_AE的访佛全长基因组序列的议论笃定了7个流行簇[46]，其中1、2、3簇主要在南部和西南部的异性和吸毒东说念主群中流行，4、5簇主要在朔方的MSM东说念主群中流行，6和7簇仅仅在2名东南和西南的异性路线感染者中发现，通盘CRF01_AE流行簇皆是在1990年代由东南亚地区传入中国的。2004－2011年发现6名日本MSM佩带中国MSM东说念主群中的CRF01_AE毒株，证实中国MSM东说念主群中CRF01_AE毒株仍是传到日本[47]。
三、CRF01_AE毒株参与酿成的重组毒株CRF01_AE自己是流行重组毒株，在传播流程中又看成母株参与酿成了其他HIV-1重组毒株。在已阐发的74个HIV-1的流行重组毒株中，由CRF01_AE参与的有20个(27%)[48]，其中由2个以上毒株基因组嵌合酿成的HIV-1 CRF(cpx)有5个，4个在非洲地区、1个在中国云南地区被发现和阐发。CRF01_ AE与A1重组的CRF有1个，是在喀麦隆发现的。CRF01_AE与B的CRF有14个，皆是在中国或东南亚地区发现的(表 1)。2009年以来在我国发现和阐发的由CRF01_AE参与的CRF毒株有CRF65_cpx、CRF55_01B、CRF59_01B、CRF67_01B和CRF68_01B。CRF65_cpx开头在云南省西部异性东说念主群中发现[49]，约莫在2000年(1997－2003年)发源于云南省，在2007年(2005－2008年)传入北京市和安徽省[50]。CRF55_01B约莫于2000年(1996－2004年)发源于深圳市的MSM东说念主群[51]，在天下7个省(市)HIV-1阳性MSM东说念主群中的流行率约为1.95%(1.5%～12.5%)，已狠恶流行[52]。
除流行重组毒株之外，还发现大皆尚未阐发流行的CRF01_AE参与特有重组型毒株(Unique Recombinant Forms，URF)，包括CRF01_ AE毒株与B和/或C的重组以及与CRF07_BC的二代重组。举例，在北京市MSM东说念主群发现的含有11个断点的CRF01_AE与B和C重组的毒株[53]，在吉林省异性东说念主群中发现的CRF01_AE/B’/C重组毒株[54]。在四川省MSM东说念主群中发现的包含6个CRF07_BC片断和5个CRF01_AE片断的二代重组毒株[55]；在江苏省发现的含有10个嵌合片断的CRF01_AE与CRF07_BC的二代重组毒株[56]、在吉林省发现的断点位于vpu/env和env的CRF01_01AE与CRF07_BC的二代重组毒株[57]等；在云南省南部[58]、北京市[59]和吉林省[60]MSM东说念主群中皆发现CRF01_AE与B的重组毒株。2008－2009年在云南省的议论发现当地URF的比例为10.3%，以CRF01_AE为骨架镶嵌B和/或C片断的重组株约占25%，出刻下性传播东说念主群中的比例显耀高于IDU东说念主群(75.0% vs. 6.3%)[61]。
除亚型间重组之外，CRF01_AE之间存在高频率的型内重组。我国流行的CRF01_AE约54.9%发源于型内重组，3个主要流行簇均发源于型内重组，存在奠基效应。讲明与型间重组激励流行雷同，型内重组也可激励大流行[62]。
四、CRF01_AE毒株的致病性多项议论发刻下MSM东说念主群中流行的CRF01_AE具有较强的致病性。一项多中心队伍议论发现，CRF01_AE呈X4嗜性的比例显耀高于其他亚型(45.5% vs. 6.1%)，与快速进展至艾滋病期(4.8年 vs. 6.4年)以及高病毒载量相关[63]。2008－2009年在中国上海市对276名新近感染HIV-1的MSM议论，发现感染CRF01_AE者的基线CD4+ T淋巴细胞(CD4)计数显耀低于感染CRF07_BC者，提醒CRF01_AE与CD4计数的快速裁汰和病程的快速进展相关[30]。随后，2009－2013年在上海市对更大样本(1 265例)新会诊HIV感染的MSM议论进一步证实了该限定[64]。2002－2007年在新加坡发现感染CRF01_AE比感染非CRF01_AE的患者CD4计数下跌的速度每年多58拷贝/mm3，从血清抗体阳转到接收抗病毒治愈的期间早1.8年[65]。
五、与CRF01_AE流行相关的社会和生物学成分分析1. 高效的性传播相聚是CRF01_AE快速流行的主要原因：奠基者效应(founder effect)是少数个体决定自后代基因频率的效应。HIV的发源[66]和要点传播均发源于奠基效应。CRF01_AE的流行也存在显耀的奠基效应，包括在泰国的流行、中国MSM东说念主群中的流行和型内重组体的流行等。传染病病原体的传播与社会成分密切相关，传染源加上大致收尾的传播路线才能导致流行。HIV的流行与性行径相聚有密切关系，当先的感染者必须是身处HIV性传播相聚中，才能有用酿成病毒流行簇。我国MSM东说念主群中相称比例的东说念主同期存在交易性伴、恐怕性伴、固定性伴和女性性伴，性伴类型和社会行径相聚极为复杂。如2012年在上海市的议论，13.9%的MSM在往常的6个月内与女性性伴发生过性步履，69.3%曾主动寻求与男性发素性步履，48.6%与恐怕性伴发生过屡次男男性步履，部分议论对象在6个月内性伴数多达50个[67]。在这种复杂的性行径相聚中，传入的CRF01_AE可快速传播酿成大的流行簇。
2. CRF01_AE参与的大皆重组毒株储备了异日流行的种子：HIV-1经性传播正常发生双重感染，两个不同的病毒同期或先后感染销亡个体，在一个细胞内复制，在回转录流程中发生模板革新而产生佩带不同亲本毒株基因片断的重组病毒[68]。HIV-1基因重组特等频繁，预计每个复制周期每个基因组至少发生2.8次重组[69]。重组是病毒进化的主要驱能源，可使其保执基因组的多态性并加多遗传各类性，获取更强的复制符合性、快速逃遁免疫响应，从而在更大的环境采纳压力下得以生涯。
艾滋病病毒感染者/艾滋病患者特殊高危东说念主群之间无保护的性步履是我国HIV-1亚型各类化的“孵化器”和“加快器”[70]。在以CRF01_AE为上风、多种毒株共同流行的布景下，极易产生CRF01_AE与CRF07_BC和/或B的重组毒株，如前所述，在我国及东南亚地区发现了大皆CRF01_AE参与的CRF和URF毒株，我国CRF01_AE的主要流行簇也发源于CRF01_AE的型内重组毒株。一般来说，重组体比其亲本毒株具有更高的复制符合性、更强的致病性和传播才智[71]。关联词，繁密CRF01_AE参与酿成的重组毒株，尽管有的已在好多地区发现流行，但皆还莫得酿成要紧的或上风的毒株。可能的原因：一是重组仅仅产生了新式重组病毒的种子，还短少将这些种子带进阔气泥土的事件，也即是莫得投入活跃的性传播相聚；二是CRF01_AE型内重组毒株现实上仍是取代其亲本成为上风毒株了，只不外刻下的议论和分析技巧只可发现型间重组而难以检出型内重组。
3. 对CRF01_AE毒株的流行趋势需要密切监测：HIV的毒力可跟着期间推移而阑珊[72]，这是由于病毒遥远流行符合东说念主体环境，获取逃遁免疫响应才智的同期付出了复制效力裁汰的代价。议论发现MSM东说念主群中流行的CRF01_AE毒力较强，从这个角度看，似乎MSM东说念主群中的CRF01_AE还相比年青。但大皆分子进化议论走漏CRF01_AE在MSM东说念主群中的流行已处于平台稳依期或呈下跌趋势，可能已是师老兵疲，而之前主要在IDU东说念主群中流行的CRF07_BC毒株[73]也出刻下MSM东说念主群中，正在飞腾何况成簇[74]，讲明MSM与IDU东说念主群之间存在密切关系，跟着HIV的传播转动为以性路线为主，CRF07_BC毒株逐渐符合了黏膜感染路线，并由在MSM东说念主群中的传播而出现了第二个流行波；异日CRF01_AE在MSM东说念主群中是连接下跌如故保管刻下水平，取决于几个成分：一是佩带CRF01_AE和CRF07_BC毒株东说念主群的性行径相聚雅致和活跃进程；二是这两个毒株的传播和符合性；三是抗病毒治愈减少传播的作用和恶果。
要而言之，CRF01_AE的故事还远莫得收尾，需要加强监测和生物学议论在线av 中文字幕，针对流行特征践诺烦闷，有用阻截HIV的传播。
利益打破 无
